Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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