Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ACTBP60709 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ACTBP60709 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ACTBP60709 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ACTBP60709 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ACTBP60709 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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