Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4BP1O75113 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms