Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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SEMA4CQ9C0C4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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SEMA4CQ9C0C4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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SEMA4CQ9C0C4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEMA4CQ9C0C4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEMA4CQ9C0C4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEMA4CQ9C0C4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEMA4CQ9C0C4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEMA4CQ9C0C4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEMA4CQ9C0C4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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