Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms