Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SEMA3CQ99985 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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