Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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