Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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