Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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