Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC099524.1-207ENST00000569731 794 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AP006565.1-201ENST00000581117 586 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 EDRF1-AS1-211ENST00000615461 592 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TEX47-201ENST00000297203 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CD48-202ENST00000368046 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC004253.1-201ENST00000583236 488 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL356585.3-201ENST00000625196 1017 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TRNT1-203ENST00000339437 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MOSPD1-202ENST00000370779 773 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms