Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms