Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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