Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TBCCD1Q9NVR7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TBCCD1Q9NVR7 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TBCCD1Q9NVR7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TBCCD1Q9NVR7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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