Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PRR11-201ENST00000262293 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 CIITA-202ENST00000381835 2344 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 RAP1GAP2-204ENST00000542807 3110 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 STAM-AS1-201ENST00000563601 2595 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 KLHL6-201ENST00000341319 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 MYO15A-203ENST00000418233 3411 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PAX8-201ENST00000263334 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 NLRP12-203ENST00000391772 3205 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ZBTB14-201ENST00000357006 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AL359317.2-201ENST00000554898 1826 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ZNF530-201ENST00000332854 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ZNF559-206ENST00000587557 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 BCDIN3D-201ENST00000333924 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AL008628.1-201ENST00000564198 5187 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PCDHGA11-203ENST00000622044 3633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PALB2-206ENST00000568219 3963 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ITGAD-201ENST00000389202 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 ZNF185-210ENST00000454925 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PRAC1Q96KF2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms