Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms