Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CUL1Q13616 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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