Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms