Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms