Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms