Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM31Q9BZY9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms