Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms