Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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