Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms