Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GSCP56915 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GSCP56915 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms