Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTAP49354 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms