Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TPRKBQ9Y3C4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TPRKBQ9Y3C4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TPRKBQ9Y3C4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TPRKBQ9Y3C4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TPRKBQ9Y3C4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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