Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms