Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF397Q8NF99 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF397Q8NF99 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms