Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP135Q66GS9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms