Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms