Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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