Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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