Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RLFQ13129 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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RLFQ13129 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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RLFQ13129 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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