Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms