Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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