Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms