Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms