Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCRL2O00421 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms