Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP15Q9Y4E8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP15Q9Y4E8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP15Q9Y4E8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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