Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms