Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms