Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms