Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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