Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
GNB1P62873 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
GNB1P62873 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
GNB1P62873 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
GNB1P62873 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
GNB1P62873 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
GNB1P62873 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
GNB1P62873 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GNB1P62873 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GNB1P62873 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms