Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC27P30260 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC27P30260 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC27P30260 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms