Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CRABP1P29762 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms