Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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