Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms