Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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