Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHDC2Q9Y2U9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms